المصدر: طلب: برامج للتعامل مع ملفات تحاليل Mass, GC, LC Spectra في منتدى : قسم البرامج العلمية حتاج برنامج x-caliber الخاص بفتح تحاليل GC-MS او ان امكن اي برنامج يفتح الداتا ..كمان لو ممكن برنامج يفتح داتا ( raw data)LCMS برنامج masslynex
السلام عليكم البرامج التالية مخصصة للتعامل مع تحاليل Mass Spectra ، وهي مجانية، والبرنامج الأول هو الأحدث == برنامج OpenMS وهو متوافق مع ويندوز 64 بت فقط رابط التحميل هذا المحتوى يظهر للاعضاء المسجلين فقط: هذا المحتوى يظهر للاعضاء المسجلين فقط: === برنامج Mass++l وهو متوافق مع ويندوز 32 و 64 بت روابط التحميل هذا المحتوى يظهر للاعضاء المسجلين فقط: هذا المحتوى يظهر للاعضاء المسجلين فقط: === لكن شخصيا لم أجرب كليهما، فضلا قم بتجريبهم، وأخبرنا إن كانا يتعاملان مع ملفات x-caliber أم لا
السلام عليكم حتى نوضح الأمور، هناك نوعان من ملفان raw ملفات raw الخاصة ببرنامج Xcalibur وتسمى Thermo raw files و ملفات raw الخاصة ببرنامج masslynx وتسمى Water .raw files والأخيرة تكون عبارة عن ملف مضغوط عند فك ضغطه ينتج مجلد بداخله ملفات بامتدادات مختلفة مثل (.dat, txt. sts, ini وغيرها) وكليهما مختلف تماما عن الآخر من ناحية المعايير === وأحد البرامج المجانية التي تتعامل مع كليهما مباشرة وبدون مشكلة هو وهذا رابط لشرح استخدامات وخصائص البرنامج --- رابط التحميل الاصدار MZMine 2.38 هذا المحتوى يظهر للاعضاء المسجلين فقط: هذا المحتوى يظهر للاعضاء المسجلين فقط: === البرنامج يعتمد على وجود التطبيقات التالية مثبتة على الجهاز قبل تشغيله: أولا Java SE runtime --- ثانيا R installer من الرابط التالي --- كيفية تشغيل MZMine تحت نظام ويندوز البرنامج من النوع المحمول، أي لا يحتاج لتثبيت، بعد تحميل ملف البرنامج، نقوم بفك ضغط الملف الناتج لنحصل على مجلد أصفر داخله داخل عدة ملفات و 3 مجلدات، ما يهمنا منها هو الملف المعنون بـ startMZmine_Windows ننقر عليه لنقوم بتشغيله وننتظر حتى يتم تحميل الواجهة الرئيسية للبرنامج --- لتشغيل ملفات raw من شريط أدوات البرنامج نضغط على Raw data method ثم من القائمة المنسدلة نختار Raw data import لتظهر نافذة لتحديد مسار ملفات raw في حالة Thermo raw نحدد مسار موقع الملف ذي الامتداد .raw على الجهاز بدون مشاكل --- أما في حالة Water raw نقوم بفك ضغط الملف أولا، ثم نحدد مسار التشغيل داخل المجلد الناتج نفسه - وليس الملف المضغوط - حتى يتعرف البرنامج على الملفات داخل المجلد مباشرة ليقوم بالتعامل معها وفتحها
لدينا أيضا البرنامج المجاني الرائع ProteoWizard === رابط التحميل هذا المحتوى يظهر للاعضاء المسجلين فقط: هذا المحتوى يظهر للاعضاء المسجلين فقط: === يشتمل هذا البرنامج على تطبيقين رئيسيين MSconvert و SeeMS --- التطبيق الأول، يقوم بتحويل ملفات raw بنوعيها (Thermo and water) إلى هيئات أكثر شهرة مثل (MzXL , MZxlm) بحيث تتعامل معها كل تطبيقات Mass , LC , GC والتطبيق الثاني، عبارة عن (Viewer) يقوم بفتح واستعراض عدد من هيئات الملفات الشائعة ومن بينها raw بنوعيها مباشرة، وبكافة التفاصيل الملحقة بالملفات. === ومن وجهة نظري هو يتفوق على برنامج MZmine من حيث سهولة الاستخدام، وخاصية تحويل الملفات التي تتم بدقة عالية، وعرضه لكافة البيانات المدمجة في ملفات التحاليل، كما أنه لا يستند لبيئة جافا التي أحيانا ما تسبب مشكلة عند تشغيلها تحت أنظمة ويندوز
اخى بدايه اشكرك علي المجهود و قد قمت بتنزيل البرنامجين ولم يفتح اي منهم ملفات LCMS كذلك فشل في تحويلها الي اي صيغه اخري يمكن التعامل معها .... اعتقد ان برنامج ACD lab به خاصيه فتح تلك الملفات والتعرف علي الداتا بها كذلك الاصدارات الحديثه من Xcaliber ولكنها للاسف غير ممكنه مجانا ف لو فيه امكانيه بمثل هذه البرامج ...
وفقا لما أرسلته لي من ملفات بصيغتي raw ، فقد نجح كلا البرنامجين تماما في التعامل مع الملفات التي أرسلتها، والبرنامج الثاني نجح في عملية تحويل وعرض كل البيانات الموجودة.
السلام عليكم دكتورنا الكريم واسف تعبت حضرتك معايا . ربنا يجزيك الخير كله . بعد اذنك . الصوره دى بتظهر معايا عند فتح ملفات LCMS المشكله ايه ؟ وما الحل؟
وعليكم السلام لا يوجد أي نوع من التعب، ربنا ييسر أمورك الصور لم تظهر، قم برفعها على أي موقع عام لرفع الصور، او ارفعها على جوجل خارج حسابك هذا رابط لملف water raw الذي أرسلته لي من قبل وقد قمت بتحويله لصيغة mzML ، وهي أحد الصيغ الشائعة التي يمكن لكل البرامج السابقة فتحها بسهولة. هذا المحتوى يظهر للاعضاء المسجلين فقط: هذا المحتوى يظهر للاعضاء المسجلين فقط: --- وهذ صورة tic Chromatogram و Spectra لنفس الملف بعد فتحها بواسطة تطبيق SeeMS ولكن بهيئة water raw مباشرة بدون تحويل، اي بصيغة الملف الاصلية التي أرسلتها.
الشكر لله وحده أخي الكريم أعتقد أنك تحتاج لتثبيت حزم البرامج التالية للويندوز قبل تشغيل البرنامج Microsoft Visual C++ 2008 SP1 Redistributable Package هذه حزمة ويندوز 32 بت، إن كانت النسخة لديك 64 بت فثبت النسخة المناسبة لجهازك -- Microsoft .NET Framework 3.5 Service Pack 1 --- NET Framework 4.7.2 غالبا حتى بعد تنزيل هذه الحزم خاصة الثانية والثالثة يجب ان يكون الجهاز متصل بالنت، حتى يستكمل عملية التثبيت، ولا تقم بقطع الاتصال أثناء التحميل.
